隨著對(duì)有機(jī)化合物研究的深入，有機(jī)化學(xué)結(jié)構(gòu)理論也逐步建立起來(lái)。1857年，德國(guó)化學(xué)家凱庫(kù)勒（Kektde）提出了“碳四價(jià)”學(xué)說(shuō)。1858年英國(guó)化學(xué)家?guī)炫粒–ouper）提出：有機(jī)化合物分子中的碳原子都是四價(jià)，而且碳原子之間可以互相連接為碳鏈。1864年，德國(guó)化學(xué)家肖萊馬（Schoi·lemmer）在此基礎(chǔ)上發(fā)展了這個(gè)觀點(diǎn)，認(rèn)為碳的四個(gè)價(jià)鍵除了自相連接外，其余的價(jià)鍵與氫結(jié)合，形成了各種各樣的烴，其他碳化物則是由別的元素取代烴中的氫衍生出來(lái)的。因此，人們將有機(jī)化學(xué)定義為研究烴及其衍生物的化學(xué)。
　　1861年，俄國(guó)化學(xué)家布特列洛夫（Butlerov）提出了較系統(tǒng)的有機(jī)化學(xué)結(jié)構(gòu)理論，他指出分子中各原子以一定化學(xué)力按照一定次序結(jié)合，稱為分子結(jié)構(gòu)；一種有機(jī)化合物具有一定的結(jié)構(gòu)，其結(jié)構(gòu)決定了它的性質(zhì)，而該化合物的結(jié)構(gòu)又可以從其性質(zhì)推導(dǎo)而來(lái)。1865年，凱庫(kù)勒提出了苯的構(gòu)造式。1874年，荷蘭化學(xué)家范特霍夫（Van’t}-IoIf）和法國(guó)化學(xué)家勒貝爾（LeBel）建立了分子的立體概念，闡明了旋光異構(gòu)和順?lè)串悩?gòu)現(xiàn)象。
　　20世紀(jì)初，在物理學(xué)一系列新發(fā)明的推動(dòng)下，特別是將量子力學(xué)的原理和方法引入化學(xué)后，建立了量子化學(xué)，闡明了化學(xué)鍵的微觀本質(zhì)，建立了誘導(dǎo)效應(yīng)、共軛效應(yīng)、立體效應(yīng)等理論。經(jīng)過(guò)眾多化學(xué)家的努力，有機(jī)化學(xué)理論得到了不斷的發(fā)展與完善，目前已經(jīng)建立了比較完整的有機(jī)化學(xué)理論體系。三、有機(jī)化合物的特性有機(jī)化合物與無(wú)機(jī)化合物在性質(zhì)上存在著一定的差異。有機(jī)化合物一般具有以下特性。1.數(shù)目龐大，結(jié)構(gòu)復(fù)雜組成有機(jī)化合物的元素不多，只有碳、氫、氧、氮、硫、磷、鹵素等少數(shù)幾種，但組成的有機(jī)化合物數(shù)量卻十分龐大。據(jù)報(bào)道，目前已知的有機(jī)物已達(dá)2000多萬(wàn)種。其原因是有機(jī)化合物中的碳原子既可成鏈，又可成環(huán)，還可與氫、氮、氧、硫、鹵素、磷等元素結(jié)合，形成各種各樣的化合物。
　　2.容易燃燒
　　除少數(shù)例外，一般有機(jī)化合物都含有碳和氫，因此容易燃燒，生成二氧化碳和水等，同時(shí)放出大量的熱量。有機(jī)物是能源的重要來(lái)源之一，如汽油、柴油、蠟、酒精、天然氣等易燃物都是有機(jī)化合物。
　　3.熔點(diǎn)和沸點(diǎn)低
　　有機(jī)化合物分子之間靠分子間力作用，結(jié)合較弱，通常為氣體、液體或低熔點(diǎn)的固體。大多數(shù)有機(jī)化合物的熔點(diǎn)在4000（：以下。一般地說(shuō)，純粹的有機(jī)化合物都有固定的熔點(diǎn)和沸點(diǎn)。因此，熔點(diǎn)和沸點(diǎn)是有機(jī)化合物的重要物理常數(shù)，人們常利用熔點(diǎn)和沸點(diǎn)的測(cè)定來(lái)鑒定有機(jī)化合物。
　　4.難溶于水，易溶于有機(jī)溶劑
　　有機(jī)化合物一般都是共價(jià)化合物，極性很小或無(wú)極性，而水是一種強(qiáng)極性物質(zhì)，所以大多數(shù)有機(jī)化合物在水中的溶解度很小，但易溶于極性小或非極性的有機(jī)溶劑（如乙醚、乙醇、苯、烴類(lèi)等），符合“相似相溶”規(guī)律。
　　5.反應(yīng)速度慢，副反應(yīng)多
　　大多數(shù)有機(jī)化合物之間的反應(yīng)要經(jīng)歷共價(jià)鍵的斷裂和新鍵的形成過(guò)程，所以反應(yīng)速度比較慢，一般需要幾個(gè)小時(shí)，甚至幾十個(gè)小時(shí)才能完成。因此，常常采用加熱、光照、攪拌或加催化劑等措施來(lái)加速有機(jī)反應(yīng)的進(jìn)行。