王慶其教授從醫(yī)執(zhí)教50余年，在讀經(jīng)典、做臨床、悟文化方面建樹良多：
（1）提出中醫(yī)學經(jīng)典的四大當代價值：打開中華文明寶庫鑰匙的文化價值、開啟認識生命另一扇門的醫(yī)學價值、激活臨床提高療效的臨床價值、開拓思路推陳致新的科研價值。
（2）提出研究經(jīng)典三途徑：用經(jīng)典激活臨床，從臨床拓展經(jīng)典；從經(jīng)典啟迪科研，用科研創(chuàng)新經(jīng)典；用文化解讀經(jīng)典，從經(jīng)典弘揚文化。
（3）創(chuàng)造新地提出《內(nèi)經(jīng)》的核心理念；五臟以藏為本，以通為用，藏中寓通；肝為調(diào)節(jié)之本；濕為百病之長；人體焦慮體質(zhì)概念等。
（4）突破桎梏揚《內(nèi)經(jīng)》臨床醫(yī)學，開創(chuàng)經(jīng)典教學查房先例；把《內(nèi)經(jīng)》理論應用于臨床結(jié)碩果。
（5）開創(chuàng)脾胃病心身問題研究之先河，積累了診治抑郁型脾胃病焦慮型脾胃病的豐富臨床經(jīng)驗。
（6）倡導由器識道，在中醫(yī)藥文化與醫(yī)學的研究中探索出頗有價值的新思路。